مسایل پیشرفته برای المپیاد شیمی خوشخوان شامل دو بخش مربوط به المپیاد مرحله دوم (سطح یک) و مرحله کشوری (سطح دو) می‌باشد که سوالات مربوط به هر بخش به چهار دسته شیمی آلی, شیمی تجزیه, شیمی فیزیک و شیمی معدنی تقسیم شده است.
تمامی سوالات به صورت تشریحی بوده و پاسخ‌های آنها به ترتیب به صورت تشریحی و جواب کوتاه برای سطح یک و سطح دو ارائه شده است.